Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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