Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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ITGA9Q13797 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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ITGA9Q13797 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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ITGA9Q13797 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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ITGA9Q13797 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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ITGA9Q13797 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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ITGA9Q13797 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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ITGA9Q13797 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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ITGA9Q13797 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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ITGA9Q13797 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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ITGA9Q13797 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA9Q13797 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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