Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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