Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf61Q13536 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms