Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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MKRN4PQ13434 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN4PQ13434 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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