Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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CALCOCO2Q13137 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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CALCOCO2Q13137 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALCOCO2Q13137 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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CALCOCO2Q13137 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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CALCOCO2Q13137 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
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CALCOCO2Q13137 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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CALCOCO2Q13137 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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CALCOCO2Q13137 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALCOCO2Q13137 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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