Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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NR1H3Q13133 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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NR1H3Q13133 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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NR1H3Q13133 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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NR1H3Q13133 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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NR1H3Q13133 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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NR1H3Q13133 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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NR1H3Q13133 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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