Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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TRAF3Q13114 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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TRAF3Q13114 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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TRAF3Q13114 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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TRAF3Q13114 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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TRAF3Q13114 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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TRAF3Q13114 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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