Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4Q12950 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms