Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 SNHG6-205ENST00000521399 302 ntTSL 216.99■□□□□ 0.313e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 FASTK-211ENST00000478883 706 ntTSL 316.83■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 FBXW2-203ENST00000476481 661 ntTSL 316.77■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 CTSH-202ENST00000525807 1122 ntTSL 516.73■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 CXXC5-203ENST00000502336 581 ntTSL 416.67■□□□□ 0.263e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 SLC26A11-204ENST00000571072 561 ntTSL 216.47■□□□□ 0.233e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 POLE-204ENST00000441786 556 ntTSL 516.45■□□□□ 0.229e-12■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.229e-12■■■■■ 29.7
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SF3A3Q12874 ADCK5-204ENST00000526833 631 ntTSL 316■□□□□ 0.153e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.159e-12■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 TRMU-209ENST00000465378 610 ntTSL 415.96■□□□□ 0.153e-8■■■■■ 29.7
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SF3A3Q12874 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.123e-8■■■■■ 29.7
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SF3A3Q12874 ENO1-204ENST00000489867 732 ntTSL 1 (best)15.44■□□□□ 0.063e-15■■■■■ 29.7
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SF3A3Q12874 CXXC5-214ENST00000512816 558 ntTSL 315.17■□□□□ 0.023e-8■■■■■ 29.7
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SF3A3Q12874 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 414.33□□□□□ -0.123e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 DYNC1LI2-206ENST00000564090 566 ntTSL 414.33□□□□□ -0.123e-8■■■■■ 29.7
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SF3A3Q12874 CTSH-215ENST00000534237 691 ntTSL 310.31□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 TRA2B-206ENST00000456380 1697 ntTSL 510.26□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 GPAA1-215ENST00000530796 936 ntTSL 310.14□□□□□ -0.799e-12■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 HSF4-207ENST00000519105 227 ntTSL 510.09□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 CHKB-CPT1B-201ENST00000452668 546 ntTSL 410□□□□□ -0.813e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 GLT8D1-211ENST00000485899 829 ntTSL 29.98□□□□□ -0.813e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 ASCC2-212ENST00000463203 385 ntTSL 29.82□□□□□ -0.843e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 TRMU-213ENST00000485175 731 ntTSL 59.53□□□□□ -0.883e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 RECQL5-203ENST00000420326 3710 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.959e-12■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 CTSH-217ENST00000534533 836 ntTSL 38.89□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 FBXO21-203ENST00000547806 367 ntTSL 38.79□□□□□ -13e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 GLT8D1-207ENST00000479553 720 ntTSL 48.73□□□□□ -1.013e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 AGAP3-215ENST00000478320 664 ntTSL 28.73□□□□□ -1.013e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 GLT8D1-202ENST00000394783 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.023e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 SPRED2-203ENST00000426832 498 ntTSL 38.52□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 HSF4-219ENST00000522027 447 ntTSL 38.48□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 ACSS2-207ENST00000470315 623 ntTSL 38.35□□□□□ -1.073e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 RALGDS-215ENST00000498797 1052 ntTSL 27.69□□□□□ -1.183e-8■■■■■ 29.7
SF3A3Q12874 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.263e-8■■■■■ 29.7
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