Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH17Q12864 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH17Q12864 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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