Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TWF1Q12792 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TWF1Q12792 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TWF1Q12792 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TWF1Q12792 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TWF1Q12792 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TWF1Q12792 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TWF1Q12792 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TWF1Q12792 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TWF1Q12792 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWF1Q12792 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TWF1Q12792 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TWF1Q12792 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TWF1Q12792 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TWF1Q12792 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWF1Q12792 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWF1Q12792 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TWF1Q12792 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TWF1Q12792 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TWF1Q12792 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TWF1Q12792 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWF1Q12792 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TWF1Q12792 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWF1Q12792 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWF1Q12792 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TWF1Q12792 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms