Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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KCNMA1Q12791 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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KCNMA1Q12791 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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KCNMA1Q12791 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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KCNMA1Q12791 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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KCNMA1Q12791 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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KCNMA1Q12791 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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KCNMA1Q12791 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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