Protein–RNA interactions for Protein: Q12462

PEX11, Peroxisomal membrane protein PMP27, yeastyeast

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX11Q12462 SWI4YER111C 3282 nt0.88□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 VPS54YDR027C 2670 nt0.88□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 OST1YJL002C 1431 nt0.88□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 KAP120YPL125W 3099 nt0.87□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 SGD1YLR336C 2700 nt0.87□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 BUD26YDR241W 288 nt0.87□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 RTR1YER139C 681 nt0.87□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 YGR265WYGR265W 411 nt0.87□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 YMR324CYMR324C 243 nt0.87□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 BRX1YOL077C 876 nt0.87□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 FMP23YBR047W 528 nt0.87□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 DPB11YJL090C 2295 nt0.87□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 YPR117WYPR117W 7470 nt0.87□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 IES5YER092W 378 nt0.86□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.86□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 YBL073WYBL073W 312 nt0.86□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 ERP4YOR016C 624 nt0.86□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 NUP82YJL061W 2142 nt0.85□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 YDL068WYDL068W 330 nt0.85□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 RTR2YDR066C 591 nt0.85□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 IRC2YDR112W 309 nt0.85□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 CMS1YLR003C 876 nt0.85□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 URA10YMR271C 684 nt0.85□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 STB6YKL072W 2301 nt0.84□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 SEC5YDR166C 2916 nt0.84□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 snR59snR59 78 nt0.84□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 YGL217CYGL217C 342 nt0.84□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 TFB6YOR352W 1032 nt0.84□□□□□ -2.27
PEX11Q12462 IFH1YLR223C 3258 nt0.84□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 SWT1YOR166C 1377 nt0.83□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 RCN1YKL159C 636 nt0.83□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 SLX4YLR135W 2247 nt0.83□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 CDC39YCR093W 6327 nt0.82□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 MSS11YMR164C 2277 nt0.82□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 LOC1YFR001W 615 nt0.82□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 LSO2YGR169C-A 279 nt0.82□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 CUP1-1YHR053C 186 nt0.82□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 CUP1-2YHR055C 186 nt0.82□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.82□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 RPS7BYNL096C 573 nt0.82□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 YPL080CYPL080C 327 nt0.82□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 UBP3YER151C 2739 nt0.82□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt0.81□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 POL32YJR043C 1053 nt0.81□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 SLS1YLR139C 1932 nt0.81□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 SGO1YOR073W 1773 nt0.8□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 YLL054CYLL054C 2532 nt0.8□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 RAD50YNL250W 3939 nt0.8□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 NUT1YGL151W 3399 nt0.8□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 GPM2YDL021W 936 nt0.8□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 TIM8YJR135W-A 264 nt0.8□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 ARV1YLR242C 966 nt0.8□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.8□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 SMC1YFL008W 3678 nt0.8□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 YJR003CYJR003C 1560 nt0.79□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 REF2YDR195W 1602 nt0.79□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 NUP145YGL092W 3954 nt0.79□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 APL3YBL037W 3078 nt0.79□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 KAR3YPR141C 2190 nt0.79□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.79□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 YIR020CYIR020C 303 nt0.79□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 RPS18BYML026C 441 nt0.79□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 YOR364WYOR364W 369 nt0.79□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 YBR184WYBR184W 1572 nt0.79□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 CRG1YHR209W 876 nt0.78□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 DFG10YIL049W 762 nt0.78□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 RPL9BYNL067W 576 nt0.78□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 YPR172WYPR172W 603 nt0.78□□□□□ -2.28
PEX11Q12462 SCC2YDR180W 4482 nt0.77□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 SAS3YBL052C 2496 nt0.77□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 CHZ1YER030W 462 nt0.77□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 SPT21YMR179W 2277 nt0.77□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 DOP1YDR141C 5097 nt0.76□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.76□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 NHP2YDL208W 471 nt0.76□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.76□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 PRM8YGL053W 714 nt0.76□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.76□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 PHS1YJL097W 654 nt0.76□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 ACF4YJR083C 930 nt0.76□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 IRC23YOR044W 474 nt0.76□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.76□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 SPR2YOR214C 711 nt0.76□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 NUP157YER105C 4176 nt0.75□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 NBP1YLR457C 960 nt0.75□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 DDR48YMR173W 1293 nt0.75□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 YCL046WYCL046W 324 nt0.75□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 PRP16YKR086W 3216 nt0.74□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 YDR521WYDR521W 336 nt0.74□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 CMC1YKL137W 336 nt0.74□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 PAU18YLL064C 363 nt0.74□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 CMC4YMR194C-B 222 nt0.74□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 PAU6YNR076W 363 nt0.74□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.74□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms