Protein–RNA interactions for Protein: Q12439

TY2A-OR1, Transposon Ty2-OR1 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2A-OR1Q12439 YJR003CYJR003C 1560 nt2.22□□□□□ -2.05
TY2A-OR1Q12439 DIS3YOL021C 3006 nt2.22□□□□□ -2.05
TY2A-OR1Q12439 SPF1YEL031W 3648 nt2.22□□□□□ -2.05
TY2A-OR1Q12439 NAB6YML117W 3405 nt2.21□□□□□ -2.05
TY2A-OR1Q12439 VPH1YOR270C 2523 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 RBK1YCR036W 1002 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 YDL152WYDL152W 366 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 WIP1YDR374W-A 270 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 YBR184WYBR184W 1572 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 VMR1YHL035C 4779 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 GIP3YPL137C 3831 nt2.2□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 PCF11YDR228C 1881 nt2.2□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 SET2YJL168C 2202 nt2.2□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 MRP10YDL045W-A 288 nt2.2□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 YFH1YDL120W 525 nt2.2□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 RPS20YHL015W 366 nt2.2□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 TOF2YKR010C 2316 nt2.2□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 MLH1YMR167W 2310 nt2.2□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 PAN3YKL025C 2040 nt2.2□□□□□ -2.06
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TY2A-OR1Q12439 SEF1YBL066C 3447 nt2.19□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 APL5YPL195W 2799 nt2.19□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 YAP6YDR259C 1152 nt2.19□□□□□ -2.06
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TY2A-OR1Q12439 TIM13YGR181W 318 nt2.19□□□□□ -2.06
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TY2A-OR1Q12439 YPR097WYPR097W 3222 nt2.19□□□□□ -2.06
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TY2A-OR1Q12439 RPL26AYLR344W 384 nt2.18□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 KTI11YBL071W-A 249 nt2.18□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 YBL083CYBL083C 426 nt2.18□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 TRL1YJL087C 2484 nt2.18□□□□□ -2.06
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TY2A-OR1Q12439 AIM9YER080W 1884 nt2.18□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 INO80YGL150C 4470 nt2.17□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.17□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 RPS27AYKL156W 249 nt2.17□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 YML003WYML003W 873 nt2.17□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 ISF1YMR081C 1017 nt2.17□□□□□ -2.06
TY2A-OR1Q12439 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.17□□□□□ -2.06
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TY2A-OR1Q12439 ZRG8YER033C 3231 nt2.17□□□□□ -2.06
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TY2A-OR1Q12439 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.14□□□□□ -2.07
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TY2A-OR1Q12439 YAR053WYAR053W 297 nt2.14□□□□□ -2.07
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TY2A-OR1Q12439 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.1□□□□□ -2.07
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TY2A-OR1Q12439 RPL42AYNL162W 321 nt2.1□□□□□ -2.07
TY2A-OR1Q12439 SYH1YPL105C 2550 nt2.1□□□□□ -2.07
TY2A-OR1Q12439 PEX8YGR077C 1770 nt2.1□□□□□ -2.07
TY2A-OR1Q12439 GUP1YGL084C 1683 nt2.09□□□□□ -2.07
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TY2A-OR1Q12439 RPL37BYDR500C 267 nt2.09□□□□□ -2.07
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TY2A-OR1Q12439 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.09□□□□□ -2.07
TY2A-OR1Q12439 CGI121YML036W 546 nt2.09□□□□□ -2.07
TY2A-OR1Q12439 YNL114CYNL114C 372 nt2.09□□□□□ -2.07
TY2A-OR1Q12439 PET309YLR067C 2898 nt2.09□□□□□ -2.08
TY2A-OR1Q12439 RPH1YER169W 2391 nt2.09□□□□□ -2.08
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