Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 YMR254CYMR254C 309 nt1.24□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 HHT1YBR010W 411 nt1.24□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 YPR177CYPR177C 372 nt1.24□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 CDC25YLR310C 4770 nt1.24□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 OSH6YKR003W 1347 nt1.23□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 YDR220CYDR220C 294 nt1.23□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 CIC1YHR052W 1131 nt1.23□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 PKR1YMR123W 369 nt1.23□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 YBL073WYBL073W 312 nt1.23□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 MAK10YEL053C 2202 nt1.23□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.23□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 MSN5YDR335W 3675 nt1.22□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 MTC7YEL033W 420 nt1.22□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 CHZ1YER030W 462 nt1.22□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 EMC5YIL027C 426 nt1.22□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 IRC19YLL033W 693 nt1.22□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 MVP1YMR004W 1536 nt1.21□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.21□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 SMB1YER029C 591 nt1.21□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 YGR265WYGR265W 411 nt1.21□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 SPO11YHL022C 1197 nt1.21□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 YLR271WYLR271W 825 nt1.21□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 YOR152CYOR152C 771 nt1.21□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 YSY6YBR162W-A 198 nt1.21□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 DGR2YKL121W 2559 nt1.21□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 Q0255Q0255 1419 nt1.21□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 AZF1YOR113W 2745 nt1.21□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 snR79snR79 84 nt1.2□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 SCEIQ0160 708 nt1.2□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 SEC28YIL076W 891 nt1.2□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 RRT15YLR162W-A 189 nt1.2□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 COX7YMR256C 183 nt1.2□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 YOL029CYOL029C 606 nt1.2□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 YOR376WYOR376W 369 nt1.2□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 SEF1YBL066C 3447 nt1.2□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 PHR1YOR386W 1698 nt1.2□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 MSH5YDL154W 2706 nt1.19□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 YIR020CYIR020C 303 nt1.19□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 SPC1YJR010C-A 285 nt1.19□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 GAL7YBR018C 1101 nt1.19□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 RPL33BYOR234C 324 nt1.19□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 IRR1YIL026C 3453 nt1.19□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 AFR1YDR085C 1863 nt1.18□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 LAA1YJL207C 6045 nt1.18□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 SPO13YHR014W 876 nt1.18□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 RPL42BYHR141C 321 nt1.18□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 RPL42AYNL162W 321 nt1.18□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 UFD2YDL190C 2886 nt1.18□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 VAM6YDL077C 3150 nt1.17□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 SEC5YDR166C 2916 nt1.17□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 YDL187CYDL187C 330 nt1.17□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 SNO3YFL060C 669 nt1.17□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 SLX9YGR081C 633 nt1.17□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 RPL34BYIL052C 366 nt1.17□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 YJR087WYJR087W 351 nt1.17□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 SNO2YNL334C 669 nt1.17□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 SMC4YLR086W 4257 nt1.17□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 NST1YNL091W 3723 nt1.16□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 YER121WYER121W 345 nt1.16□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 RPC10YHR143W-A 213 nt1.16□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 FCF2YLR051C 654 nt1.16□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 YLR252WYLR252W 306 nt1.16□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 DCP2YNL118C 2913 nt1.16□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 KIP1YBL063W 3336 nt1.16□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 BUD3YCL014W 4911 nt1.15□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 MUK1YPL070W 1839 nt1.15□□□□□ -2.22
MSH5Q12175 YER175W-AYER175W-A 165 nt1.15□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 RCN1YKL159C 636 nt1.15□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 AFB1YLR040C 675 nt1.15□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 MSS11YMR164C 2277 nt1.15□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 GUP1YGL084C 1683 nt1.14□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 PRP21YJL203W 843 nt1.14□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 RPL40BYKR094C 387 nt1.14□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 CTK3YML112W 891 nt1.14□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 YNL050CYNL050C 813 nt1.14□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 SWS2YNL081C 432 nt1.14□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 NOP15YNL110C 663 nt1.14□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 YCL046WYCL046W 324 nt1.14□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 TIM18YOR297C 579 nt1.13□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 MEI5YPL121C 669 nt1.13□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 YPR063CYPR063C 423 nt1.13□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 APL1YJR005W 2103 nt1.13□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 YLL054CYLL054C 2532 nt1.12□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 YDL211CYDL211C 1119 nt1.12□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.12□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 VMA21YGR105W 234 nt1.12□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 PAU18YLL064C 363 nt1.12□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 PAU6YNR076W 363 nt1.12□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.12□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 ZRG17YNR039C 1818 nt1.12□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 RAD50YNL250W 3939 nt1.12□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 SEC3YER008C 4011 nt1.11□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 HDA3YPR179C 1968 nt1.11□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 YDL152WYDL152W 366 nt1.11□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 SLM6YBR266C 453 nt1.11□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 CDC24YAL041W 2565 nt1.11□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.1□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt1.1□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 YNL114CYNL114C 372 nt1.1□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 YNL319WYNL319W 441 nt1.1□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.8 ms