Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 VPS3YDR495C 3036 nt3.83□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 OST4YDL232W 111 nt3.83□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.83□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 RPB10YOR210W 213 nt3.83□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 BOI1YBL085W 2943 nt3.83□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 POM152YMR129W 4014 nt3.83□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 NIP100YPL174C 2607 nt3.82□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.82□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.82□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.82□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.82□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.82□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 YCL019WYCL019W 5313 nt3.82□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt3.82□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 ATP7YKL016C 525 nt3.82□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 RPL22AYLR061W 366 nt3.82□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 snR45snR45 172 nt3.82□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 AHC1YOR023C 1701 nt3.81□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 SEF1YBL066C 3447 nt3.8□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt3.8□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 snR43snR43 209 nt3.8□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 NUP159YIL115C 4383 nt3.8□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 SPC98YNL126W 2541 nt3.79□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 PEP3YLR148W 2757 nt3.79□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 YDR239CYDR239C 2364 nt3.79□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.79□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt3.79□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 YBR225WYBR225W 2703 nt3.79□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 ATG13YPR185W 2217 nt3.79□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 ORC1YML065W 2745 nt3.79□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 APL5YPL195W 2799 nt3.78□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 CMC4YMR194C-B 222 nt3.78□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 YPL044CYPL044C 549 nt3.78□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 MYO5YMR109W 3660 nt3.78□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 RPB2YOR151C 3675 nt3.78□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 YNR065CYNR065C 3351 nt3.78□□□□□ -1.8
TFB4Q12004 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt3.77□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 RRM3YHR031C 2172 nt3.77□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 FIG4YNL325C 2640 nt3.77□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 ARO80YDR421W 2853 nt3.76□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.76□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 CDC31YOR257W 486 nt3.76□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 YBR206WYBR206W 324 nt3.76□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 AI2Q0055 2565 nt3.76□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 YIL080WYIL080W 4722 nt3.76□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 YBL012CYBL012C 402 nt3.75□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 APE2YKL157W 2859 nt3.74□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 RPL23BYER117W 414 nt3.74□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 RPS12YOR369C 432 nt3.74□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 RPL33AYPL143W 324 nt3.74□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 SWI6YLR182W 2412 nt3.74□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 MSC6YOR354C 2079 nt3.74□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 NOC3YLR002C 1992 nt3.73□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 FAP7YDL166C 594 nt3.73□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 YCL046WYCL046W 324 nt3.73□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 MLH2YLR035C 2088 nt3.73□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 CTF4YPR135W 2784 nt3.73□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 YJL120WYJL120W 324 nt3.72□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt3.72□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 SWH1YAR042W 3567 nt3.72□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 DIA2YOR080W 2199 nt3.72□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 ALA1YOR335C 2877 nt3.72□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 RPH1YER169W 2391 nt3.71□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 ARO1YDR127W 4767 nt3.71□□□□□ -1.81
TFB4Q12004 NOP4YPL043W 2058 nt3.71□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 UBP11YKR098C 2154 nt3.71□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 PHD1YKL043W 1101 nt3.71□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 RPS25BYLR333C 327 nt3.71□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 NCR1YPL006W 3513 nt3.71□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 RFX1YLR176C 2436 nt3.71□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 SPT4YGR063C 309 nt3.7□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 AIM44YPL158C 2277 nt3.69□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 SMY1YKL079W 1971 nt3.69□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 SRP14YDL092W 441 nt3.69□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 SOM1YEL059C-A 225 nt3.69□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 COX19YLL018C-A 297 nt3.69□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 YNL114CYNL114C 372 nt3.69□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 YAT2YER024W 2772 nt3.69□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 FLO9YAL063C 3969 nt3.69□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 GIS1YDR096W 2685 nt3.68□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 YCR043CYCR043C 384 nt3.68□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 PAU3YCR104W 375 nt3.68□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 RGM1YMR182C 636 nt3.68□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 SLY1YDR189W 2001 nt3.68□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt3.67□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 TMA19YKL056C 504 nt3.67□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 LRG1YDL240W 3054 nt3.67□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 STU1YBL034C 4542 nt3.67□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 CHD1YER164W 4407 nt3.67□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 LOS1YKL205W 3303 nt3.66□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 YDL118WYDL118W 381 nt3.66□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 RPL42BYHR141C 321 nt3.66□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 SNF5YBR289W 2718 nt3.65□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 GLC3YEL011W 2115 nt3.65□□□□□ -1.82
TFB4Q12004 NOG1YPL093W 1944 nt3.64□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 PBY1YBR094W 2262 nt3.64□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 MNE1YOR350C 1992 nt3.64□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 RAD26YJR035W 3258 nt3.64□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 RPL42AYNL162W 321 nt3.64□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 RCY1YJL204C 2523 nt3.64□□□□□ -1.83
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