Protein–RNA interactions for Protein: Q12000

TMA46, Translation machinery-associated protein 46, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA46Q12000 YLR278CYLR278C 4026 nt2.9□□□□□ -1.94
TMA46Q12000 SPO14YKR031C 5052 nt2.9□□□□□ -1.94
TMA46Q12000 PEP3YLR148W 2757 nt2.9□□□□□ -1.94
TMA46Q12000 CDC27YBL084C 2277 nt2.9□□□□□ -1.94
TMA46Q12000 YDR426CYDR426C 378 nt2.9□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 SNC1YAL030W 354 nt2.9□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 EMC6YLL014W 327 nt2.9□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.9□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 CYB5YNL111C 363 nt2.9□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 YDR186CYDR186C 2634 nt2.89□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 SMY1YKL079W 1971 nt2.89□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 CBF2YGR140W 2871 nt2.89□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 snR55snR55 98 nt2.89□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 YGR050CYGR050C 357 nt2.89□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 VPS34YLR240W 2628 nt2.89□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 EFR3YMR212C 2349 nt2.89□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 VPH1YOR270C 2523 nt2.89□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 FLO11YIR019C 4104 nt2.89□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 ILS1YBL076C 3219 nt2.89□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 RTT10YPL183C 3042 nt2.88□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 YEL043WYEL043W 2871 nt2.88□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 PAU10YDR542W 363 nt2.88□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 PAU11YGL261C 363 nt2.88□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 TRX1YLR043C 312 nt2.88□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 PAU4YLR461W 363 nt2.88□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 RPS12YOR369C 432 nt2.88□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.88□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 HOS4YIL112W 3252 nt2.87□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 RGC1YPR115W 3252 nt2.87□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 INP52YNL106C 3552 nt2.87□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 TAO3YIL129C 7131 nt2.87□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 RPL6AYML073C 531 nt2.87□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 CRM1YGR218W 3255 nt2.87□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 STE6YKL209C 3873 nt2.87□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 SWR1YDR334W 4545 nt2.86□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 HSC82YMR186W 2118 nt2.86□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 PXA2YKL188C 2562 nt2.86□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 GRR1YJR090C 3456 nt2.86□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 RSN1YMR266W 2862 nt2.86□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 YGR067CYGR067C 2415 nt2.86□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 SNQ2YDR011W 4506 nt2.86□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 RRP6YOR001W 2202 nt2.86□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 GEA1YJR031C 4227 nt2.86□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 UTP14YML093W 2700 nt2.85□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 SCH9YHR205W 2475 nt2.85□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 ISD11YER048W-A 285 nt2.85□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 CFT2YLR115W 2580 nt2.85□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 AMS1YGL156W 3252 nt2.85□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 SNF5YBR289W 2718 nt2.84□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 BNR1YIL159W 4128 nt2.84□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.84□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.84□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 YOR302WYOR302W 78 nt2.84□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 KAP104YBR017C 2757 nt2.84□□□□□ -1.95
TMA46Q12000 RIF1YBR275C 5751 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 GIS1YDR096W 2685 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 VMR1YHL035C 4779 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YGL052WYGL052W 306 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 GPG1YGL121C 381 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YJL182CYJL182C 318 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 RPS22AYJL190C 393 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YNL028WYNL028W 318 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YNL114CYNL114C 372 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YBL083CYBL083C 426 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YOR015WYOR015W 360 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 SLH1YGR271W 5904 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YME2YMR302C 2553 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 MRD1YPR112C 2664 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 LCD1YDR499W 2244 nt2.83□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 CDC53YDL132W 2448 nt2.82□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 BUD4YJR092W 4344 nt2.82□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 SSQ1YLR369W 1974 nt2.82□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 PFF1YBR074W 2931 nt2.82□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 PAU2YEL049W 363 nt2.82□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 RPL42BYHR141C 321 nt2.82□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 RPL42AYNL162W 321 nt2.82□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 CSE2YNR010W 450 nt2.82□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 TOM1YDR457W 9807 nt2.82□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 POL3YDL102W 3294 nt2.81□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YPL216WYPL216W 3309 nt2.81□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 SSS1YDR086C 243 nt2.81□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 RPL23BYER117W 414 nt2.81□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 ERP6YGL002W 651 nt2.81□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 PFD1YJL179W 330 nt2.81□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.81□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 MNL2YLR057W 2550 nt2.81□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 MGM1YOR211C 2646 nt2.81□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 PLC1YPL268W 2610 nt2.81□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 ECM29YHL030W 5607 nt2.8□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 IRR1YIL026C 3453 nt2.8□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.8□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.8□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.8□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 YMR321CYMR321C 318 nt2.8□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 RPL33AYPL143W 324 nt2.8□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 SAP1YER047C 2694 nt2.8□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 RPH1YER169W 2391 nt2.8□□□□□ -1.96
TMA46Q12000 SMY2YBR172C 2223 nt2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.2 ms