Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLFN5Q08AF3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN5Q08AF3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms