Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DSC1Q08554 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms