Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP1-1Q07627 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-1Q07627 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms