Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms