Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms