Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCZQ05513 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCZQ05513 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms