Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms