Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 YPL197CYPL197C 414 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM12Q04235 HMI1YOL095C 2121 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 TTI1YKL033W 3117 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 RVS161YCR009C 798 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 snR78snR78 87 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YGR283CYGR283C 1026 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 TIM10YHR005C-A 282 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YJL015CYJL015C 285 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YKL111CYKL111C 336 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 IRR1YIL026C 3453 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 UTP13YLR222C 2454 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 SNO3YFL060C 669 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 SLX9YGR081C 633 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YNL050CYNL050C 813 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 SNO2YNL334C 669 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YOL159CYOL159C 516 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 SIP4YJL089W 2490 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 RSM22YKL155C 1887 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 MSC6YOR354C 2079 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 PET123YOR158W 957 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YPR147CYPR147C 915 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 REF2YDR195W 1602 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 AFR1YDR085C 1863 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 RLM1YPL089C 2031 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YBR184WYBR184W 1572 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YDR220CYDR220C 294 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 CHZ1YER030W 462 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 SCEIQ0160 708 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 SPO13YHR014W 876 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 LRP1YHR081W 555 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YLR271WYLR271W 825 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 CGI121YML036W 546 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YNL319WYNL319W 441 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 FMP23YBR047W 528 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 RAD9YDR217C 3930 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 CIC1YHR052W 1131 nt1.11□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.11□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 PRP21YJL203W 843 nt1.11□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 VPS52YDR484W 1926 nt1.11□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 MLH3YPL164C 2148 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 SPC1YJR010C-A 285 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YJR087WYJR087W 351 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 IRC19YLL033W 693 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 NBP1YLR457C 960 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 KAP122YGL016W 3246 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 BEM2YER155C 6504 nt1.09□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 snR79snR79 84 nt1.09□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YDL187CYDL187C 330 nt1.09□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 CRG1YHR209W 876 nt1.09□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YIR020CYIR020C 303 nt1.09□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 YLR252WYLR252W 306 nt1.09□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 COX7YMR256C 183 nt1.09□□□□□ -2.23
TRM12Q04235 SMC4YLR086W 4257 nt1.09□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 NCA2YPR155C 1851 nt1.09□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 VMA21YGR105W 234 nt1.08□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 AFB1YLR040C 675 nt1.08□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 SPT7YBR081C 3999 nt1.08□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 MAK10YEL053C 2202 nt1.08□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 MDS3YGL197W 4464 nt1.08□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 MSH5YDL154W 2706 nt1.08□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 MSS11YMR164C 2277 nt1.08□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.07□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 MTC7YEL033W 420 nt1.07□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 RPC10YHR143W-A 213 nt1.07□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 YJL022WYJL022W 309 nt1.07□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt1.07□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 HNT1YDL125C 477 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 SMB1YER029C 591 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 YER175W-AYER175W-A 165 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 RPL42BYHR141C 321 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 RCN1YKL159C 636 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 RPL42AYNL162W 321 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 YOR152CYOR152C 771 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 ALK1YGL021W 2283 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 OSH6YKR003W 1347 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 MSN5YDR335W 3675 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 EST2YLR318W 2655 nt1.05□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 GPM2YDL021W 936 nt1.05□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.05□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 COF1YLL050C 432 nt1.05□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 RRT15YLR162W-A 189 nt1.05□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 YBL073WYBL073W 312 nt1.05□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 YSY6YBR162W-A 198 nt1.05□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 SEF1YBL066C 3447 nt1.05□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 APL2YKL135C 2181 nt1.05□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 SEC5YDR166C 2916 nt1.05□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 YAR009CYAR009C 3591 nt1.04□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 STF2YGR008C 255 nt1.04□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 YIL029CYIL029C 429 nt1.04□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 HCH1YNL281W 462 nt1.04□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 HHT1YBR010W 411 nt1.04□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 SHE9YDR393W 1371 nt1.04□□□□□ -2.24
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