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Protein–RNA interactions for Protein: Q03048
COF1, Cofilin, yeast
Known RBP
Predictions only
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143 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
COF1
Q03048
YJL086C
YJL086C
369 nt
0.52
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
ATG16
YMR159C
453 nt
0.52
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YMR324C
YMR324C
243 nt
0.52
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YPL039W
YPL039W
951 nt
0.52
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YCL046W
YCL046W
324 nt
0.52
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
NUP157
YER105C
4176 nt
0.52
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YDL073W
YDL073W
2955 nt
0.51
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
ATC1
YDR184C
885 nt
0.51
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
SMB1
YER029C
591 nt
0.51
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
NUT1
YGL151W
3399 nt
0.5
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
CHZ1
YER030W
462 nt
0.5
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
IES5
YER092W
378 nt
0.5
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YGL042C
YGL042C
306 nt
0.5
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
NBP1
YLR457C
960 nt
0.5
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YBL029C-A
YBL029C-A
285 nt
0.5
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YBR012C
YBR012C
420 nt
0.5
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
NUP120
YKL057C
3114 nt
0.5
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YBR184W
YBR184W
1572 nt
0.49
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
UTP10
YJL109C
5310 nt
0.49
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
MXR1
YER042W
555 nt
0.49
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
VPS63
YLR261C
327 nt
0.49
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YML002W
YML002W
2214 nt
0.48
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
MPT5
YGL178W
2580 nt
0.48
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YDR248C
YDR248C
582 nt
0.48
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
VPS74
YDR372C
1038 nt
0.48
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YBR221W-A
YBR221W-A
105 nt
0.48
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YDR034C-C
YDR034C-C
1317 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YFL002W-B
YFL002W-B
1317 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YGR161W-A
YGR161W-A
1317 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YLR410W-A
YLR410W-A
1317 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YBL100W-A
YBL100W-A
1317 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YOR192C-A
YOR192C-A
1317 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YCL020W
YCL020W
1317 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YDL206W
YDL206W
2289 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
REF2
YDR195W
1602 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YGR045C
YGR045C
363 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
RPL42B
YHR141C
321 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
YLR366W
YLR366W
306 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
GIM5
YML094W
492 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
DIA1
YMR316W
1011 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
RPL42A
YNL162W
321 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
DCP2
YNL118C
2913 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COF1
Q03048
KAR3
YPR141C
2190 nt
0.46
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
NUP82
YJL061W
2142 nt
0.46
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
YGL109W
YGL109W
324 nt
0.46
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
PAU18
YLL064C
363 nt
0.46
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
RPL38
YLR325C
237 nt
0.46
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
PAU6
YNR076W
363 nt
0.46
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
YBR200W-A
YBR200W-A
165 nt
0.46
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
YDL068W
YDL068W
330 nt
0.45
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
YDL196W
YDL196W
330 nt
0.45
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
SWF1
YDR126W
1011 nt
0.45
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
RTT102
YGR275W
474 nt
0.45
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
BMT5
YIL096C
1011 nt
0.45
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
PAM16
YJL104W
450 nt
0.45
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
NOC3
YLR002C
1992 nt
0.45
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
SET3
YKR029C
2256 nt
0.44
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
RKR1
YMR247C
4689 nt
0.44
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
NHP2
YDL208W
471 nt
0.44
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
RUB1
YDR139C
234 nt
0.44
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
RPS7B
YNL096C
573 nt
0.44
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
NUT2
YPR168W
474 nt
0.44
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
PIG1
YLR273C
1947 nt
0.44
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
RMD6
YEL072W
696 nt
0.43
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
ANS1
YHR126C
480 nt
0.43
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
GPX1
YKL026C
504 nt
0.43
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
YPR172W
YPR172W
603 nt
0.43
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
SUS1
YBR111W-A
291 nt
0.43
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
AIM44
YPL158C
2277 nt
0.43
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
YDR521W
YDR521W
336 nt
0.42
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
RNR4
YGR180C
1038 nt
0.42
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
TIM8
YJR135W-A
264 nt
0.42
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
YMR158C-A
YMR158C-A
138 nt
0.42
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
CMC4
YMR194C-B
222 nt
0.42
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
PRP16
YKR086W
3216 nt
0.42
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
snR83
snR83
306 nt
0.41
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
YMR075C-A
YMR075C-A
366 nt
0.41
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
UFE1
YOR075W
1041 nt
0.41
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
YOR199W
YOR199W
330 nt
0.41
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
TYE7
YOR344C
876 nt
0.41
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
HDA3
YPR179C
1968 nt
0.41
□□□□□ -2.34
COF1
Q03048
YLL007C
YLL007C
1998 nt
0.4
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
15S_rRNA
15S_rRNA
1649 nt
0.4
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
GPM2
YDL021W
936 nt
0.4
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
ECM12
YHR021W-A
456 nt
0.4
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
SLM6
YBR266C
453 nt
0.4
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
SAG1
YJR004C
1953 nt
0.39
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
TMA22
YJR014W
597 nt
0.39
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
RPS30A
YLR287C-A
192 nt
0.39
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
GUP1
YGL084C
1683 nt
0.39
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
STO1
YMR125W
2586 nt
0.38
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
SHE9
YDR393W
1371 nt
0.38
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
ZIP1
YDR285W
2628 nt
0.37
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
SRP14
YDL092W
441 nt
0.37
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
YDR509W
YDR509W
348 nt
0.37
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
YEL057C
YEL057C
702 nt
0.37
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
SNO3
YFL060C
669 nt
0.37
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
ALG13
YGL047W
609 nt
0.37
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
LSM12
YHR121W
564 nt
0.37
□□□□□ -2.35
COF1
Q03048
YIL030W-A
YIL030W-A
339 nt
0.37
□□□□□ -2.35
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