Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BNC1Q01954 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms