Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms