Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MS4A2Q01362 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms