Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
SRSF2Q01130 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF2Q01130 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms