Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F1Q01094 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F1Q01094 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms