Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAP1AP62834 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAP1AP62834 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms