Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms