Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms