Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-16P61578 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms