Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms