Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTBP60709 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTBP60709 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTBP60709 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTBP60709 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTBP60709 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTBP60709 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTBP60709 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTBP60709 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTBP60709 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTBP60709 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTBP60709 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTBP60709 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTBP60709 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms