Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms