Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA3P59666 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms