Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX16P57768 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX16P57768 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX16P57768 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX16P57768 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX16P57768 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX16P57768 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX16P57768 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX16P57768 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX16P57768 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX16P57768 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX16P57768 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX16P57768 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX16P57768 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX16P57768 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX16P57768 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX16P57768 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX16P57768 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX16P57768 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX16P57768 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX16P57768 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms