Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BACE1P56817 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BACE1P56817 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BACE1P56817 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BACE1P56817 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BACE1P56817 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BACE1P56817 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms