Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELLP55199 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELLP55199 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ELLP55199 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ELLP55199 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELLP55199 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms