Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCKAP1LP55160 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms