Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHBP55084 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHBP55084 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHBP55084 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHBP55084 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHBP55084 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHBP55084 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHBP55084 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHBP55084 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHBP55084 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHBP55084 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHBP55084 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHBP55084 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHBP55084 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHBP55084 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHBP55084 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHBP55084 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHBP55084 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHBP55084 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHBP55084 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHBP55084 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHBP55084 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHBP55084 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHBP55084 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHBP55084 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHBP55084 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHBP55084 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHBP55084 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHBP55084 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHBP55084 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHBP55084 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHBP55084 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHBP55084 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHBP55084 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHBP55084 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHBP55084 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHBP55084 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHBP55084 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHBP55084 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHBP55084 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHBP55084 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms