Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COPAP53621 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPAP53621 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPAP53621 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COPAP53621 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPAP53621 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPAP53621 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPAP53621 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPAP53621 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPAP53621 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPAP53621 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPAP53621 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
COPAP53621 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPAP53621 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPAP53621 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPAP53621 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPAP53621 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPAP53621 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPAP53621 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPAP53621 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPAP53621 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPAP53621 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPAP53621 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms