Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP2P53365 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms