Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LUMP51884 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LUMP51884 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LUMP51884 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms