Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSRP3P50461 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSRP3P50461 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms