Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK2P49760 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK2P49760 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK2P49760 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK2P49760 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK2P49760 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms